siRNA och hur det används i molekylärgenetisk forskning

siRNA Funktion

Före När du dyker in i exakt vad siRNA är (inte att förväxla med miRNA), är det viktigt att känna till RNA:s funktion. Ribonukleinsyra (RNA) är en nukleinsyra som finns i alla levande celler och fungerar som en budbärare som bär instruktioner från DNA för att kontrollera syntesen av proteiner.

I virus kan RNA och DNA bära information.

Genom att göra det förhindrar siRNA produktionen av specifika proteiner baserat på nukleotidsekvenserna för deras motsvarande mRNA. Processen kallas RNA-interferens (RNAi), och kan också kallas siRNA-tystnad eller siRNA-knockdown.

Var de kommer ifrån

siRNA anses allmänt vara har kommit från längre strängar av exogent växande eller som härrör från utanför en organism (RNA som tas upp av cellen och genomgår vidare bearbetning).

RNA:t kommer ofta från vektorer, såsom virus eller transposoner (en gen som kan ändra positioner i ett genom). Dessa har visat sig spela en roll i antiviralt försvar, nedbrytning av överproducerat mRNA eller mRNA för vilka translation har avbrutits, eller förhindrar störningar av genomiskt DNA av transposoner.

Varje siRNA-sträng har en 5' (fem-prim) fosfatgrupp och en 3' hydroxyl (OH) grupp. De produceras av dsRNA eller hårnålsögla RNA som, efter att ha kommit in i en cell, delas av ett RNase III-liknande enzym, kallat Dicer, med hjälp av RNase eller restriktionsenzymer.

SiRNA:t inkorporeras sedan i ett proteinkomplex med flera subenheter som kallas RNAi-inducerat tystande komplex (RISC). RISC ”söker upp” ett lämpligt mål-mRNA, där siRNA sedan lindas upp och, man tror, ​​antisenssträngen styr nedbrytningen av den komplementära strängen av mRNA, genom att använda en kombination av endo- och exonukleasenzymer.

Användningar av siRNA

När en däggdjurscell står inför ett dubbelsträngat RNA såsom siRNA , kan det misstag det som en viral biprodukt och initiera ett immunsvar. Dessutom kan införandet av ett siRNA orsaka oavsiktlig off-targeting där andra icke-hotande proteiner också kan attackeras och slås ut.

Att införa för mycket siRNA i kroppen kan resultera i ospecifika händelser på grund av medfödd immunsvarsaktivering, men givet förmågan att slå vilken gen som helst av intresse, siRNA har potential för många terapeutiska användningar.

Många sjukdomar kan potentiellt behandlas genom att hämma genuttryck, genom att kemiskt modifiera siRNA för att förbättra deras terapeutiska egenskaper. Några egenskaper som skulle kunna förbättras är:

Förbättrad aktivitet

Ökad serumstabilitet och färre avvikande mål

Minskad immunologisk aktivering

Därför har designen av syntetiskt siRNA för terapeutisk användning blivit en populär mål för många biofarmaceutiska företag.

En detaljerad databas över all sådan kemisk modifiering är manuellt kurerad på siRNAmod, en manuellt kurerad databas med experimentellt validerade kemiskt modifierade siRNA.